2007年4月，南京师范大学在数学科学学院设立了全校第一个本科人才培养教学特区。学校给予特殊政策，投入专项资金，推进特区高质量人才培养工作。特区以数学、统计学两个一级学科博士点和博士后科研流动站为依托，以省部共建本科教学实验室为实践训练平台，强化学生研究能力和创新能力培养，旨在为国家培养高层次研究与教学人才，为现代企业培养高层次的应用型人才。

　　为进一步提高人才培养质量，自2009年起，学院在数学与应用数学专业以特区基地班形式招生和培养，专门为国家培养、输送研究型数学人才。学院与国内一流大学共享优质资源，每年从录取的数学类新生中，选拨16名左右的江苏优秀考生，其中8名选送中国科学技术大学，8名选送南京大学强化培养。委托培养期间，依据学生学习情况进行滚动，时间为弹性的1-3学期，之后返校在数科院基地班继续学习深造。

　　特区基地班采用特殊的培养方案，由各学科带头人、博士生导师亲自授课，由学术水平高、责任心强的专业教师担任班主任，指导学生学会规划、学会学习，学会研究、学会创新、学会发展，为优秀学生搭建学习和发展的广阔平台。基地班毕业生具有扎实的理论基础和良好的科研能力，以此优势继续深造，免试保送或考取研究生，攻读硕士、博士学位。