农学系是我国创立最早的农学系科之一，2000年10月撤系建立农学院。在110年的办学历史中，一大批农业科技的奠基人和开拓者在本院任教，包括著名小麦育种家、中国科学院院士、前中国农业科学院院长金善宝教授，著名棉花育种家、中国科学院院士冯泽芳教授，著名数量遗传和大豆育种家马育华教授等，还培养了一批知名学者、教育家、企业家及省市级领导干部。经过几代人的艰苦努力，农学院已经建立了理念先进、层次完整、机制成熟的人才培养体系，构筑了结构合理、求实创新的学术梯队，形成了诚朴、勤奋、合作、创新的优良院风。全院现有教职工133名，其中中国工程院院士2名，“千人计划”专家1名，“长江学者”特聘教授2名，教授40名，副教授43名。建院以来，农学院已累计培养本科生2200余人，硕、博研究生2400余人。

　　农学院现建有作物遗传与种质创新国家重点实验室、国家大豆改良中心和国家信息农业工程技术中心3个国家级平台、8个省部级重点实验室和5个工程中心。拥有作物学国家重点一级学科，以及2个国家级重点二级学科(作物遗传育种学、作物栽培学与耕作学)、2个江苏省重点交叉学科(农业信息学、生物信息学)。设有1个博士后流动站、8个博士专业、5个硕士专业、3个本科专业。独立设有明天奖学金、英才奖学金、宁粳奖学金、金华隆奖学金和新纪元树人奖学金等。还与全国各行政事业、科研教学和企业单位建立了紧密的人才培养和就业协作基地。

　　“十五”以来承担国家“973”计划、“863”计划、 国家科技支撑计划、转基因重大专项、农业部公益性行业专项、国家自然科学基金等国家及部省级科研课题和国际合作研究课题400多项，累计研究经费超过5亿元。获得国家科技进步一等奖1项，国家科技进步二等奖5项、国家科学技术发明二等奖1项、部省级科技成果奖励15项，获国家发明专利83项、植物新品种保护权23个、软件著作权73个，制定省颁标准46项，培育出大豆、小麦、棉花、水稻等省农作物新品种60个。

　　农学院大力拓展国际合作与学术交流领域，先后与美国、日本、英国、加拿大、荷兰、澳大利亚等国家的30余所大学和科研机构建立了长期的合作关系，同时还与美国康奈尔大学、伊力诺依大学、俄勒冈州立大学、荷兰瓦赫宁根大学、日本千叶大学等建立了本科生“2+2”、“1+2+1”联合培养计划。每年接待合作研究与交流人员达150人次以上。