化学系始建于1958年，她的前身为淮阴师范专科学校化学科，1985年更名为淮阴师范专科学校化学系。

　　多年的办学过程中，化学系积累了较为丰富的办学经验。1985-1988年，化学系挂靠南京师范大学招收化学专业本科生。1996年，除招收三年制师范专业专科生外，同时还挂靠徐州师范大学招收化学专业本科生。1997年，经国务院批准，原淮阴师范专科学校与淮阴教育学院合并，成立淮阴师范学院，化学系全面开始本科生的培养工作。化学系现有化学(师范)、应用化学、化学工程与工艺、环境科学四个本科专业，在藉学生960余人。

　　经过多年的建设，化学系已经形成了一支教学经验丰富、学历层次高，科研能力强的研究队伍。全系现有专任教师51人,其中教授12人，副教授15人，具有博士学位13人(另还有9人在读)，35岁以下的专任教师全部具有硕士及以上学位，具有研究生学历教师的比例占71%。教师队伍中，有省级学术带头人1名，省级优秀青年骨干教师4名，院级学科带头人和学术骨干教师7名，兼职博士生导师1名，硕士生导师10名。2004年来，我系共发表论文227篇，其中SCI(E)、EI收录的文章有77篇，anguage: EN-US; mso-fareast-language: ZH-CN; mso-bidi-language: AR-SA">项;申报各级各类课题50项，其国际合作项目1项，国家自然科学基金4项(两项与外校合作)，教改课题7项，获奖成果16项。

　　化学系实验室设备齐全，环境优良，能够满足日常教学和教师科研需求。化学实验楼使用面积达10100m2，拥有核磁共振波谱仪(400兆)，高效液相色谱-质谱，电感耦合等离子体-原子发射光谱仪等仪器设备价值1700余万元。依托化学系而建的“低维材料化学实验室”为江苏省重点实验室，“化学实验中心”为省高校基础课实验教学示范中心。此外，化学系还有“江苏省羰基金属合成工程技术研究中心”、市“绿色化工”工程研究中心各一个。多年来，化学系十分重视专业建设、学科建设和课程建设，并取得较好成绩。化学系化学专业为江苏省“特色”专业;化学系无机化学学科为院重点学科，应用化学学科为院重点建设学科，2006年，化学系被评为院学科建设优秀单位;《有机化学》、《物理化学》为省级二类精品课程，《分析化学》、《无机化学》为院重点建设优秀课程。

　　本着“厚基础、宽口径、重能力”的人才培养模式，在多年的办学过程中，我们始终坚持以素质教育为主线，突出对学生实践能力和创新精神的培养，通过规范管理，强化教风，鼓励考研和参加社团等渠道加强学风建设，取得良好的效果。近年来，毕业生就业率一直保持在98%以上，受到用人单位的普遍好评。