机电工程系创建于1989年，现设有机械制造与自动化、机电一体化、数控技术、应用电子技术和电气自动化、电梯工程技术等六个专业，其中机电一体化、机械制造与自动化、电气自动化专业为院级重点建设专业。

　　全系专任教师33人，其中副教授11人，具有硕士学历学位教师19人，90%以上的教师具备“双师型”素质，校外企业兼职教师25人，50%以上具有高级职称。各类在籍学生近1500人。

　　经过二十多年的建设和发展，积累了丰厚的办学资源和经验，建有可供识岗实习、多个工种职业技能培训和承接外加工等功能的综合性实训中心1个，有可供课程实训和承担高校职业技能大赛有关项目培训的理实一体化实训室22个。

　　始终坚持“校企合作、工学交替”的人才培养模式，倡导“将企业引入校园，把课堂搬进车间”的理念教育培养学生，推行理实一体、课证融通的教学体系。先后与南通科技、润邦电气、南通富来威、南辉电子等单位合作，在校外建立了33个学生实习实训和就业基地。毕业生就业前景广阔，近几年毕业生就业率在98%以上。启动引入机制，将苏州帝奥电梯有限公司南通分公司引入校园，共建南通帝奥电梯工程学院，联合培养电梯专门人才;与南通大学合作在校内共建“南通市传热与过程节能重点实验室农校研究性实训基地”，紧密围绕南通市的主导产业开展新产品研发、技术研究、应用推广等，教师的科研和社会服务能力有了很大的提高。

　　近三年，系部教师主持或参与省市级科研项目十多项，在国家核心期刊、省级及以上刊物发表论文百余篇，获国家专利6项，院级精品课程2个，教师自编教材10 多本，教师指导学生参加省、市多项职业技能大赛均取得较好成绩。机电工程系创新“三段式”爱心教育品牌，实践“校居共建”教育模式，特色鲜明，2008年机电工程系“特困生爱心群体”被评为“南通市第31次文明新风典型”，2013年机电工程系被评为南通大中专院校学生思想政治教育工作先进集体和南通市 “168”爱生先进集体。