动物科学学院前身始建于1953年，时为安徽凤阳农业学校畜牧兽医科，1965年开始本科教育，成立畜牧兽医系，1995年更名为动物科学系，2005年更名为动物科学学院。

　　动物科学学院现有动物科学、动物医学、动物生物技术和动植物检疫四个本科专业。其中:动物医学专业为国家级特色专业、省级卓越农林人才教育培养计划建设专业;动物科学专业为省级特色专业、省级卓越农艺师教育培养计划建设专业、省级综合改革试点专业。2012年学院开始进行硕士研究生教育。

　　学院设置有动物医学系和动物科学系，下设5个教研室(基础兽医学、临床兽医学、预防兽医学、动物遗传育种与繁殖学和动物营养与饲料学教研室)、3个本科教学实验室(动物科学、动物医学、基础兽医学实验室)。学院拥有1个省级重点实验室(家禽疫病防控监测实验室)、1个省级示范实习实训中心(兽医临床诊疗实习实训中心)、4个研究所(家禽研究所、草食动物研究所、动物药品研究所和禽病研究所)。实验室面积超过5000多平方米，实验仪器设备总值1000多万元。

　　学院拥有兽医院、GMP兽药厂、畜牧科技园、SPF实验动物中心和普通实验动物房5个校内实践教学实习基地，先后与美国泰森食品集团，美国嘉吉集团，美国邦基集团，北京北农大集团、大北农集团、广东温氏集团、中牧集团、北京伟嘉集团、大连三仪集团、台湾大成集团、上海源耀投资股份公司、艾格菲国际集团、中粮集团肉食(江苏)，中粮集团东海粮油工业有限公司等60多家校外企事业单位建立了长期校企联合办学与共建关系。

　　学院现有专任教师45人，教授、副教授占60%以上、硕士及以上学位教师近60%;国家级、省级优秀教师、模范教师和省级拔尖人才、中青年学科带头人8人，省级教学名师、教坛新秀各1人;省现代农业产业技术体系首席专家1人，岗位专家9人;10多位教师在其他高校和科研院所担任硕士研究生导师。近三年学院教师获各类奖励50多项，其中省级以上奖励12项。

　　近五年来，学院主持和参加省部级以上科研课题40多项，厅级科研课题50多项，科研经费达600多万元。获市、厅级以上科研成果奖励10余项、国家发明专利8项，完成具有完全知识产权的国家行业标准1项。撰写或参编教材和著作20多部，每年在省级以上学术刊物上发表研究论文100篇左右。

　　50多年来，学院至今已培养了42届本科毕业生，38届专科毕业生，毕业学生总数接近9000人。毕业生就业率近年来始终接近100%，创业典型不断涌现，行业企业满意度日益提升。

　　学院连续多年被评为校“优秀教学院部”、“优秀教学工作单位”、“就业工作先进单位”。2012年，学院被省教育厅授予“省级高等学校优秀教学管理单位”荣誉称号，学院党总支荣获“全省创先争优先进基层党组织”荣誉称号。