汽车与轨道交通学院是全国应用型本科院校协作组组长单位南京工程学院的二级教学院系，是江苏省汽车工程学会常务理事单位、南京市城市轨道交通发展协会会员单位、江苏省轨道车辆现代化装备工程研究中心挂靠单位之一、南京工程学院-深圳安车科技汽车检测室挂牌单位。现有一个车辆工程学科，一个机械工程领域全日制专业硕士研究方向(车辆机械技术状况智能监测)，两个本科专业即：车辆工程专业[含车辆工程(汽车技术)、车辆工程(城市轨道车辆)两个专业方向]，交通设备与控制工程专业。现有全日制本科学生1100余人(含民办本科)，毕业生一次就业率高于98%。

　　汽车与轨道交通学院下设办公室、学生工作办公室(共青团分团委)、车辆工程研究所、汽车教研室、轨道车辆教研室、交通控制教研室和车辆工程实验中心。现有教师近40人，其中：行政管理人员(含学工辅导员)7人，专业教师30余人;兼有讲师和硕士以上学位教师占全部教师总数的90%;高、中级职称比例为48%：52%;博士、硕士、学士比例为30%：60%：10%。

　　汽车与轨道交通学院的教学工作以新能源汽车及常规汽车设计、制造、运用，轨道车辆设计、制造、维修，交通运输车辆机电设备和电子电气系统设计、制造、维护为主要教学内涵，并逐步形成了〈新能源汽车〉教学团队、〈车辆电子电气〉教学团队和〈轨道车辆电力牵引〉教学团队。

　　汽车与轨道交通学院的科技工作主要围绕新能源汽车电子控制和轨道车辆设计制造展开，在新能源汽车动力混合器、动力电池管理系统、燃料电池发动机试验台，以及轨道车辆门系统振动、冲击分析等领域开展产学研合作，同时对于常规汽车的运用开展深入研究，获得纵向课题资助，并形成了“汽车技术状况检测与控制”和“轨道车辆动态设计与动力学分析”两个研究方向。

　　车辆工程实验中心历年来陆续受到“中央与地方共建高校特色优势学科实验室项目”、“中央财政支持地方高校发展专项资金项目”和“中央与地方共建高校基础实验室建设项目“的资助，设有汽车实验室、交通控制实验室、轨道车辆实验室和计算机房，具有新能源汽车、常规汽车、城市轨道车辆、汽车电子等四类教学科研设备，价值860余万元、占地面积2135m2，拥有PSV-400-B扫描式激光测振仪、NEC-R300W2 R10红外热像仪等一批科研仪器。

　　汽车与轨道交通学院适应国家持续开展城市轨道交通建设、加快实施节能-新能源汽车战略、强化汽车关键零部件技术自主化的局面，以交通运输工程学科建设为龙头，以汽车与轨道交通行业需求为引领，以汽车与轨道交通专业建设为载体，以教师科技能力建设、教学团队建设、专业核心课程建设为基础。计划用六年左右时间将汽车与轨道交通学院建成本科生规模适度、学科专业特色明显、与行业结合度较高、本科专业群设置合理、办学效益较高，在省内同类院校和行业中具有一定影响的学校二级教学单位，形成由车辆工程学科、车辆工程专业、汽车服务工程专业、交通设备与控制工程专业、轨道交通信号与控制专业组成的汽车与轨道交通学科专业群。