上海交通大学医学院药学系筹建于2003年，是在医学院药物研究所的基础上整合了原上海第二医科大学药理学、医学化学及医学相关学科的教学和研究资源，以上海交通大学医学院的综合力量为依托组建而成。从创建伊始药学系的一切工作都围绕一流学科建设展开。目前药物化学是上海市教委重点学科，药学系还设有临床药理研究中心和药效学、药动学研究室等。自2005年开始招生，每年招收本科生30名，研究生8名(其中博士生4名)。

　　药学系现设本科药学专业、药物化学及药理学硕士点和药理学博士点。本科生的培养方向为药学。培养目标为培养德、智、体全面发展的具有现代药学理论、基本知识和技能的药学专门人才。教学以采用法语教学为特色，教学中培养学生的创新意识和适应先进技术的能力，使学生能在药物的生产、检验、流通、使用、研制和开发领域从事药物的设计、研发、制剂和临床合理用药等工作，也能够从事药学的教学、科研和管理工作。为了提高学生运用法语的能力，第一学年的课程设置强化法语教学，部分专业课程聘请外方教师主讲。

　　药学系现有教工50名，其中教授5名，副教授12名。药学系教授在药学领域享有较高的知名度，并兼任重要学术职务。药学系教师在完成教学任务的同时，积极开展科研工作。近年来，在肿瘤靶向治疗，神经营养和神经保护作用中药药理等方面开展了重点研究。目前承担了国家、教育部、上海市等各类科研课题二十余项。

　　现任主要负责人：

　　系主任：陆阳

　　副主任：陈红专

　　地址：上海市重庆南路280号交通大学医学院药学系

　　邮编：200025

　　电话：(8621)63846590-776464

　　邮箱：huaxue@shsmu.edu.cn