温州医学院药学院创办于2001年,设有药学系、中药学系、生物制药工程系、实验中心和执业药师培训与继续教育中心。拥有国家精品课程1门，浙江省精品课程4门;药学专业为国家特色专业。药学、中药学为一级学科硕士授予点;拥有浙江省重点实验室，浙江省“重中之重”学科，浙江省教学示范中心。获国家技术发明二等奖1项、国家科技进步二等奖1项、中华医学科技一等奖1项、吴阶平医学研究奖-保罗杨森药学研究奖二等奖1项。

　　学院现有教师94人，其中高级职称30位;博士26位，硕士42位;博士生导师3人，硕士生导师31人。拥有“长江学者”特聘教授1人、教育部新世纪优秀人才1人、“新世纪百千万人才工程”国家级人选1人、“钱江学者”1人、浙江省特聘教授1人。指导学生获得大学生“挑战杯”比赛国家二等奖。

　　学院拥有实习基地40余个，野外见习基地6个。