物理与电子工程学院是在1958年苏州师范专科学校数理科的基础上发展起来的，1986年物理系成立，设物理教育专业，层次为专科，主要培养苏南地区初中骨干教师。1996年物理系物理师范专业开始挂靠苏州大学招收本科生。随着社会的需要和物理系教学层次的提高，2003年物理系改名为物理与电子科学系，并开始招收电子科学与技术专业本科生。2004年学校升本，物理与电子科学系正式以常熟理工学院的名义招收本科生。2008年7月，学校院系设置调整，在物理与电子科学系的基础上设立物理与电子工程学院。

　　学院现有物理学(师范)、电子科学与技术、光电信息工程、电子信息工程、新能源科学与工程5个本科专业，其中，物理学(师范)专业为省级特色专业，其他专业被列为省级重点专业类建设;新能源科学与工程专业为教育部“十二五”专业综合改革试点项目;光电信息工程专业和电子信息工程专业为省级卓越工程师教育计划试点专业。建有江苏省纺织机械工程研究中心、江苏省新功能材料重点建设实验室、江苏省基础物理实验示范中心以及江苏省电工电子实验教学中心4个省级教学科研平台，建有智能仪器研究所、计算物理与材料计算2个校级研究所。共建有江苏省材料学重点建设学科、以及凝聚态物理、物理电子学和检测技术与自动化装置(合建)校级重点学科。2009年6月，成立阿特斯光伏科技学院，并开始招收光电信息工程(光伏技术与产业)专业学生,2012年起开始招收新能源科学与工程专业学生。目前全日制在校学生1900余人。

　　学院现有教职工81人，其中教授9人、副教授22人、博士(含在读)32人，政府特殊津贴专家1名、省“333高层次人才培养工程”科学技术带头人3名、省“人才高峰计划”2名、省优秀学术带头人2名、省优秀青年骨干教师5人，外聘兼职教授6人，硕士生导师6人。已经形成了一支职称结构、年龄结构、学历结构和学缘结构比较合理、充满活力的师资队伍。现有实验设备资产2400多万元，实验用房12000多平方米。

　　近年来，学院承担14项国家自然科学基金项目，10多项部省科研项目和30多项校企合作开发项目。在国内外刊物上发表论文600多篇，其中近100多篇被SCI收录，30多篇EI收录，部分论文在Nature Materials, Physical Review Letters, Physical Review B, Applied Physics Letters等国际一流学术刊物上发表。出版学术著作、教材10余部，获得专利授权17项，软件著作授权9项。教师科技成果曾获教育部科技成果二等奖，江苏省高校科技进步三等奖1项，苏州市科技进步二等奖一项、三等奖3项，获得省级教学成果奖和教学竞赛奖多项。

　　学院围绕"注重学理、亲近业界"的应用型人才培养理念，注重培养学生专业素养和创新能力。形成了学科竞赛、学生科研、社会实践等特色工作。近两年，学生在全国大学生物理技能大赛、电子设计竞赛、机器人大赛、软件设计大赛、数学竞赛等多项全国性、省级竞赛上获得重要奖项。

　　学院以工程技术特色创优势，以基础研究创新求发展，加强学科建设和专业建设，不断提高教学质量和科研能力，加强校地互动和校企合作，培养适应社会需求的应用型人才。