机械电子工程学院，1958年招收第一届本科生，1960年建系。1994年1月成立机械工程学院，1997年7月更名为机械电子工程学院。

        学院现有教职工98人。其中，教授16名，副教授35名，“333工程”人员2名，江苏省“青蓝工程”人员4名。为全校开课200余门，近几年出版教材30多部，发表论文500多篇，取得专利30多项，完成课题近200项。
        学院下设林业机械系、机械制造工程系、自动化系、过程装备与控制工程系、测控技术系、机械电子工程系、工程图学教研室、力学教研室、机械基础实验中心、机械工程实验中心和自动化与测控技术实验中心。实验室总面积6700多平方米，仪器设备价值约1200多万元。
        学院现有机械工程一级学科博士后科研流动站、机械工程一级学科博士点、机械工程一级学科硕士点；机械制造及其自动化、机械电子工程、机械设计及理论、车辆工程等4个二级学科博士点；机械制造及其自动化、机械电子工程、机械设计及理论、车辆工程、检测技术与自动化装置、农业机械化工程、控制理论与控制工程等7个二级学科硕士点；机械工程、控制工程等2个工程硕士专业学位点，农业机械化农业推广硕士专业学位点。

        学院现有机械设计制造及其自动化（两个专业方向：机械设计及其自动化、机械制造及其自动化）、 机械电子工程、自动化、过程装备与控制工程、测控技术与仪器等5个本科专业，其中机械设计制造及其自动化为国家级特色专业建设点，机械设计制造及其自动化、机械电子工程、过程装备与控制工程为江苏省重点专业。
        学院目前在校本科生1400余人，研究生100多人。良好的教风和学风使我院培养的学生受到用人单位的欢迎，多年来供不应求，历届毕业生就业率一直位居全省前列。
        学院积极开展对外学术交流，先后派教师赴美国、德国、日本、芬兰、韩国等国进修访问和合作研究，并多次邀请和接待美国、德国、加拿大、越南等国专家来学院学术交流。机械电子工程学院在多年的科研与教学中，建立了优良的科研设施条件和雄厚的科研队伍，形成了具有特色的研究方向：现代机械设计及理论、新型林业与木工机械设计、机械振动噪声研究、机电一体化及CAD/CAM、机械材料结构强度研究、精准施药技术与装备、农产品深加工技术与装备、植保机械、农林机器人、螺杆泵设计、物流工程、数字影像及控制技术等等。近年来主持和参加国家科技支撑计划、国家“863”、国家“948”、国家自然科学基金、国家公益性行业科研专项、部省级科研项目60余项，累计科研经费1500多万元，与国内外产学研机构具有广泛联系。