学校科学研究立足国际前沿，充分发挥学科齐全的优势，通过学科群建设，促进了学科的交叉、渗透，显著提高了科技创新能力。学校建有“天然药物活性组分与药效”国家重点实验室，已建成完整的临床前创新药物研发各节点相关的省部级重点实验室、技术平台、工程技术中心13个，承担的高水平研究课题项目数和成果转让经费数在国内医药院校中位居前列。“十一五”以来，在科技部组织的十六项“国家科技重大专项”之一的“重大新药创制”专项中承担着数十项建设任务，获得资助经费2.15亿元，承担的项目数与获得资助经费数均列全国高校第一;获得包括国家科技进步奖二等奖2项在内的省部级以上科技奖77项，新药证书52本，授权专利301项;在核心期刊发表论文6019篇，其中3325篇论文被SCI、EI收录。